SPOŁECZNA ODPOWIEDZIALNOŚĆ NAUKI

"UWOLNIJ UMYSŁ" - AKADEMIA DLA SPOŁECZEŃSTWA, SPOŁECZNOŚĆ DLA AKADEMII

WIĘCEJ INFORMACJI

O PRACOWNI BIOBANK

Pracownia Biobank jest jednostką naukową Uniwersytetu Łódzkiego zajmującą się zagadnieniami biologii molekularnej i genetyki oraz pobieraniem, gromadzeniem, przechowywaniem i udostępnianiem materiału biologicznego.
U podstaw powstania Pracowni Biobank leżała idea zainicjowania na Uniwersytecie Łódzkim działalności w obszarze biobankowania materiału biologicznego opartej o wiedzę i najnowszą technologię.

W naszej pracowni zdeponowana jest głównie ślina oraz krew, ale posiadamy również zaplecze techniczne do biobankowania surowicy, osocza, komórek jednojądrzastych.

Obecnie jako jeden z siedmiu ośrodków w kraju tworzymy ogólnopolskie Konsorcjum na rzecz Infrastruktury Badawczej Biobanków i Zasobów Biomolekularnych BBMRI (Biobanking and BioMolecular Resource Researche Infrastructure) i współtworzymy Polską Sieć Biobanków zrzeszającego największe Biobanki w Polsce.

Od roku 2016 należymy również do dwóch innych organizacji zrzeszających biobanki: ESBB (European and Middle Eastern Society for Biopreservation and Biobanking) oraz BCNet (Biobank and Cohort Building Network).

REALIZOWANE PROJEKTY NAUKOWE I KOMERCYJNE

Pracownia Biobank to nie tylko biobankowane materiału biologicznego ale również działalność naukowa i komercyjna w obszarze biologii molekularnej. 60 Zrealizowanych projektów komercyjnych. 70 Grantów badawczych i projektów naukowych.

Celem projektu “Uwolnij Umysł” - akademia dla społeczeństwa, społeczność dla akademii jest wzmocnienie dialogu na linii lokalnych społeczności województwa łódzkiego, a środowiskiem akademickim Uniwersytetu Łódzkiego przy wsparciu lokalnych samorządów.  Przeprowadzone przez naukowców wydarzenia będą celowały w edukowanie członków lokalnej społeczności w zakresie wpływu interdyscyplinarnych badań populacyjnych na kształtowanie się polityki społeczno-ekonomicznej i zdrowia publicznego oraz uświadomienie uczestnikom, że poprzez zaangażowanie w proces pozyskiwania danych mogą Oni mieć realny wpływ na kształtowanie się wiedzy z tego zakresu.
Naukowcy Uniwersytetu Łódzkiego już od dziesięcioleci prowadzą badania związane z analizą postaw społecznych, aspektów psychologicznych życia codziennego i badania populacyjne wraz z oceną wpływu genotypu na fenotyp. W każdym ze wskazanych obszarów środowisko akademickie zależne jest od chęci uczestnictwa w takich badaniach przedstawicieli społeczeństwa. Wzajemne zrozumienie jest więc kluczowe dla osiągniecia celów badań naukowych. Popularyzacja nauki oraz zastosowań wyników badań naukowych, poprzez organizację cyklicznych zajęć (w postaci wykładów, pokazów i warsztatów w szkołach podstawowych, miejskich ośrodkach kultury i festynach) na terenie województwa łódzkiego ma wzmocnić pozytywny odbiór nauki oraz poziom wiedzy na temat wpływu nauki na społeczeństwo. Wyjaśnienie wartości zangażowania się poszczególnych przedstawicieli lokalnych społeczności w projekty naukowe oraz zaznaczenie istotności efektów tych badań, podkreśli wpływ jaki dzisiejsze badania mają na życie przyszłych pokoleń.  
Udział w zaplanowanych zajęciach szkolnych, popularyzatorskich w regionalnych ośrodkach kulturowych i zajęć zaplanowanych na festynach regionalnych będzie bezpłatny, językiem obowiązującym będzie język polski. Przewidywana liczba uczestników - 10 000 osób.

Projekt dofinansowany ze środków budżetu państwa, przyznanych przez Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego w ramach Programu ,,Społeczna Odpowiedzialność Nauki II”

Uniwersytet Łódzki - Pracownia Biobank realizuje projekt „Medical University of Lodz – Digital Medicine Center (MULDiMediC)”.

Projekt realizowany jest przez Konsorcjum w składzie:

  • Uniwersytet Medyczny w Łodzi (Lider)
  • Samodzielny Publiczny Zakład Opieki Zdrowotnej Uniwersytecki Szpital Kliniczny nr 1 im. Norberta Barlickiego Uniwersytetu Medycznego w Łodzi (Partner)
  • Samodzielny Publiczny Zakład Opieki Zdrowotnej Centralny Szpital Kliniczny Uniwersytetu Medycznego w Łodzi (Partner)
  • Samodzielny Publiczny Zakład Opieki Zdrowotnej Uniwersytecki Szpital Kliniczny im. Wojskowej Akademii Medycznej Uniwersytetu Medycznego w Łodzi – Centralny Szpital Weteranów (Partner)
  • Uniwersytet Łódzki (Partner)
  • Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie (Partner)

Projekt finansowany jest ze środków Agencji Badań Medycznych w ramach Konkursu Tworzenie i rozwój Regionalnych Centrów Medycyny Cyfrowej, nr ABM/2023/2. Numer umowy: 2023/ABM/02/00009. Kwota dofinansowania projektu: 29 980 257,15 zł. Kwota dofinansowania dla Uniwersytetu Łódzkiego: 1 753 500,00 zł.

OPIS PROJEKTU:

Projekt MULDiMediC ma na celu stworzenie nowej jakości w obszarach badań biomedycznych i medycyny klinicznej. Przedsięwzięcie wzmocni potencjał kluczowych szpitali specjalistycznych województwa łódzkiego, zwielokrotni możliwości badań w zakresie medycyny molekularnej oraz biobankowania, a także stworzy faktyczne centrum analiz, testowania i wdrażania rozwiązań informatycznych, biostatystycznych i bioinformatycznych do praktyki klinicznej i naukowej.

Aby ujednolicić dokumentację medyczną, stworzyć spójny system referencyjny i zoptymalizować procesy integracji, zaślepiania, udostępniania i analizy danych w ramach trzech wysokospecjalistycznych szpitali i grupy jednostek POZ, które współpracują z Liderem Projektu, wprowadzony zostanie szereg narzędzi wspierających pracę lekarza, a także zakupiony zostanie odpowiedni sprzęt. Model unifikacji danych w ramach systemów informatycznych szpitali pozwoli na łatwiejszą integrację, umożliwi bardziej szczegółowe wyszukiwanie danych i zapewni skuteczniejsze monitorowanie bezpieczeństwa terapii. Wdrożenie systemu asystenta lekarza z wykorzystaniem AI przyspieszy pracę personelu medycznego, dodatkowo poprawi jakość dokumentacji medycznej, co w konsekwencji zapewni wysoką jakość analiz epidemiologicznych, w tym ocen wykonalności wymaganych do badań klinicznych. Wzmocniona zostanie współpraca biobanków w regionie - zwielokrotnione zostaną możliwości archiwizacji próbek pochodzących z badań klinicznych i naukowych, w szczególności w onkologii i immunologii. Poprzez integrację na poziomie systemów analizy genetycznej, Biobank Uniwersytetu Łódzkiego umożliwi wykorzystanie współdzielonych zasobów danych o zmienności genetycznej w celu poprawy dokładności diagnostyki całogenomowej.

Zbudowany z zamierzeniem efektywności naukowej system Regionalnego Centrum Medycyny Cyfrowej, wzmocniona infrastruktura IT i rozszerzone możliwości biobanku pozwolą na tworzenie rozwiązań cyfrowych, umożliwiających współdzielenie danych medycznych, wdrażanie rozwiązań z wykorzystaniem zaawansowanych statystyk i uczenia maszynowego oraz eksport danych do baz centralnych.

Powstałe w Projekcie Regionalne Centrum Medycyny Cyfrowej ułatwi pacjentom dostęp do specjalistycznej opieki medycznej i zapewni nowe ścieżki rekrutacji do badań klinicznych. Wyniki Projektu MULDiMediC obejmą kompleksowe podniesienie jakości danych medycznych, wzmocnienie potencjału naukowego, umożliwią prowadzenie na skalę populacyjną innowacyjnych badań z zakresu analizy dużych danych medycznych oraz diagnostyki całogenomowej.

Pracownia Biobank Uniwersytetu Łódzkiego jest jednym z założycieli konsorcjum BBMRI.pl powstałego w ramach projektu „Utworzenie sieci biobanków w Polsce w obrębie Infrastruktury Badawczej Biobanków i Zasobów Biomolekularnych BBMRI-ERIC”, przyznanego na podstawie Decyzji Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego (dalej: Ministra) nr DIR/WK/2017/01.

W skład konsorcjum prócz Pracowni Biobank Uniwersytetu Łódzkiego wchodzi Biobank Wrocławskiego Centrum Badań EIT+ Sp. z o. o, Centralny Bank Tkanek i Materiału Genetycznego w Zakładzie Medycyny Diagnostyki Laboratoryjnej Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, Pracownia Inżynierii Tkankowej w Zakładzie Histologii i Embriologii Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego, Uniwersytet Medyczny w Lublinie, Uniwersytet Medyczny im Piastów Śląskich we Wrocławiu oraz Regionalne Centrum Naukowo-technologiczne w Podzamczu. Ośrodki konsorcjantów skupiają specjalistów od lat zajmujących się biobankowaniem ludzkiego materiału biologicznego oraz prowadzeniem badań naukowych.

Członkami konsorcjum są osoby posiadające doświadczenie w każdym z aspektów nauki (począwszy od pozyskiwania środków na finansowanie, poprzez ich rozliczanie, prowadzenie badań naukowych, wdrażanie ich wyników przy zachowaniu zasad etycznych, przepisów prawnych oraz standardów jakościowych).

Głównym celem konsorcjum BBMRI.pl jest utworzenie Polskiej Sieci Biobanków w oparciu o działania europejskiego partnera BBMRI-ERIC. Budowa wspólnej infrastruktury wpłynie na zwiększenie doskonałości naukowej i skuteczności polskich badań w dziedzinie nauk biomedycznych oraz zwiększenie konkurencyjności polskich badań i krajowego przemysłu B+R w kontekście europejskim i międzynarodowym.

Wskazanie właściwej ścieżki rozwoju na początku funkcjonowania jednostek biobankujących pozwoli ukształtować placówki biobankujące według standardów europejskich. Krajowa sieć ma przygotować polskie biobanki do pracy w ramach europejskiej sieci biobanków BBMRI-ERIC. Publikacja katalogów próbek na poziomie europejskiej struktury, lepsza organizacja polskich placówek biobankujących na poziomie jakościowym oraz informatycznym ma służyć nawiązywaniu współpracy wieloośrodkowej między zespołami naukowymi i klinicznymi z terenu całej Europy.

W ramach realizowanego projektu konsorcjum opracowało sześć głównych zadań, których realizacja jest konieczna do tego, aby polskie ośrodki mogły podejmować równorzędną współpracę z partnerami z zagranicy w ramach BBMRI-ERIC:

Zadanie 1. Zidentyfikowanie i charakterystyka podmiotów zainteresowanych wejściem do sieci biobanków polskich.
Zadanie 2. Wprowadzenie spójnych rozwiązań w zakresie IT.
Zadanie 3. Wyznaczenie standardów biobankowania materiału biologicznego do celów naukowych; wcielenie wspólnych rozwiązań.
Zadanie 4. Utworzenie Krajowego Ośrodka Wiodącego w Zakresie Biobankowania.
Zadanie 5. Wprowadzenie jednolitego system kontroli jakości wszystkich etapów funkcjonowania krajowych biobanków.
Zadanie 6. Analiza aspektów etycznych, prawnych i społecznych biobankowania ludzkiego materiału biologicznego w Polsce.

Pracownia Biobank Uniwersytetu Łódzkiego odpowiedzialna jest za realizacje zadania drugiego, w ramach którego odpowiedzialna jest za utworzenie jednolitego systemu informatycznego, obsługującego podstawowe funkcje biobanków.

 

Numer projektu:
decyzja MNiSW nr DIR/WK/2017/01
z dnia 27.01.2017r.

Okres realizacji projektu:
27.01.2017-31.12.2021

Całkowita kwota projektu:
39 549 517,00 zł
Dofinansowanie: 39 549 517,00 zł

Projekt współfinansowany ze środków Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego Rzeczypospolitej Polskiej

logo_1logo_2

Numer projektu:
projekt finansowany w ramach konkursu „GRIEG-1”, nr umowy/decyzji UMO-2019/34/H/NZ8/00683

Okres realizacji projektu:
2020 -2023

Całkowita kwota projektu:
Wartość przyznanego dofinansowania 6387134 zł, budżet UŁ 2069166 zł

Funkcja
Koordynator Zadania UŁ

Numer projektu:
projekt finansowany w ramach konkursu „GRIEG-1”, nr umowy/decyzji UMO-2019/34/H/NZ8/00683

Okres realizacji projektu:
2020 -2023

Całkowita kwota projektu:
Wartość przyznanego dofinansowania 6387134 zł, budżet UŁ 2069166 zł

Funkcja
Koordynator Zadania UŁ

Numer projektu:
Przyznany na podstawie decyzji Rady Naukowej Fundacji Polpharma, w dniu 09.10.2018 r

Okres realizacji projektu:
od 2018-05-23 do 2021-12-31

Całkowita kwota projektu:
Wartość przyznanego dofinansowania 549840 zł

Funkcja:
Koordynator Zadania UŁ

logotypy_1

Głównym celem projektu jest digitalizacja genetycznych zasobów pracowni Biobank oraz udostępnienie ich z wykorzystaniem repozytorium Local EGA. Local EGA – lokalna (Polska) instancja Europejskiego Archiwum Genomów i jako pierwsza w kraju powstanie na Uniwersytecie Łódzkim.

Wykorzystanie repozytorium Local EGA oznacza włączenie przechowywanych w nim danych do Europejskiego ekosystemu naukowo-badawczego (nadzorowanego przez Europejski Instytut Bioinformatyki, Center for Genomic Regulation i konsorcjum Elixir) otwierając drogę do realizacji międzynarodowych projektów badawczych. W repozytorium dane będą mogli zdeponować wszyscy zainteresowani udostępnianiem danych naukowcy nie tylko z UŁ.

Zastosowane mechanizmy kontroli dostępu – komitet dostępu do danych (skład określany przez dysponenta zbioru) oraz szyfrowanie z wykorzystaniem infrastruktury klucza publicznego zapewnia kuratorowi zbioru całkowitą kontrolę nad udostępnianymi danymi oraz warunkami na jakich dostęp może zostać przyznany.

Wygenerowane w trakcie projektu dane (pełne genomy i egzomy) stworzą interesujący dla badaczy zbiór danych o szerokich zastosowaniach w nauce w szczególności w rozwoju medycyny spersonalizowane. Pozwolą także na dalsze kontynuowanie prac badawczych prowadzonych w ramach pracowni, nad zmiennością genetyczną populacji Polskiej.

Efektem realizacji projektu będzie również zwiększenie możliwości analitycznych Biobanku Łódź poprzez zakup wysoko przepustowego sekwenatora nowej generacji (NGS). Otwierając w ten sposób szanse na stworzenie na Uniwersytecie Łódzkim specjalistycznego centrum sekwencjonowania genomu o zasięgu globalnym.

Projekt jest finansowany z  Programu Operacyjnego Polska Cyfrowa

Numer projektu:
nr umowy/decyzji POPC.02.03.01-00-0097/19-00

Okres realizacji projektu:
2020-2023

Całkowita kwota projektu:
Finansowanie dla projektu Uniwersytetu Łódzkiego wynosi 10 000 000 PLN. Kwota dofinansowania ze środków europejskich to 8 463 000zł

Numer projektu:
nr umowy/decyzji OPUS12 (NCN), nr 2016/23/B/NZ8/03145; 

Okres realizacji projektu:
2017-2021

Całkowita kwota projektu:
Wartość przyznanego dofinansowania 794640 zł

Numer projektu:
nr umowy/decyzji UMO-2019/35/B/NZ7/00942

Okres realizacji projektu:
2020 -2023

Całkowita kwota projektu:
Wartość przyznanego dofinansowania 2424060 zł, budżet UŁ 536520 zł.

Funkcja:
Koordynator Zadania UŁ

logotypy_2Głównym celem projektu jest udostępnienie genetycznych zasobów Biobanku UŁ i Katedry Antropologii UŁ na platformie dostępnej w internecie, w sposób ułatwiający ich ponowne wykorzystanie.

W ostatnich dziesięcioleciach każdego dnia ośrodki naukowo-badawcze generują ogromne ilości danych (big data – wielkie dane) o znacznej wartości naukowej. Tymczasem w Polsce wdrażanie nowych rozwiązań, takich jak porządkowanie i ułatwianie dostępu do danych naukowych w dalszym ciągu jest mało popularną praktyką. Źródłem tego problemu jest, między innymi, brak otwartości kadry naukowo-badawczej na proces ogólnoświatowej cyfryzacji ściśle związany ze specyfiką zawodu i reguł panujących w placówkach badawczych. W erze wielkich danych największym wyzwaniem nie jest więc samo przeprowadzanie eksperymentów badawczych, lecz możliwość opracowania systemu łatwej wymiany danych.

Wytworzenie platformy zawierającej cenne dane, skierowanej do jednej z największej grupy odbiorców – internautów, przyczyni się więc do wyznaczenia nowych standardów w dziedzinie cyfrowego udostępniania danych naukowych.

Projekt przyczyni się również do wzrostu ilości publicznie dostępnych danych – siedem miliardów pól danych na temat ludzkiego genomu (polskiej populacji na próbie 6400 osób) czeka na udostępnienie. Zbiór ten zostanie wzbogacony o zasoby Katedry Antropologii. Planowany do realizacji zakres cyfryzacji kolekcji szkieletowej z okresu od XI do początku XIX wieku, pochodzącej z pięciu stanowisk archeologicznych (cmentarzysk), zlokalizowanych w rejonie Brześcia Kujawskiego na Kujawach, obejmie pozyskanie cyfrowego zapisu sekwencji aDNA (ancient DNA – DNA starożytne).

Prestiżowy konkurs przeprowadziło Centrum Projektów Polska Cyfrowa w ramach Programu Operacyjnego Polska Cyfrowa. Warto podkreślić, iż w skali Polski tylko 5 wniosków uzyskało wymaganą liczbę punktów i uzyskało dofinansowanie.

Projekt jest finansowany z Programu Operacyjnego Polska Cyfrowa

Numer projektu:
Platforma informacyjna e-Człowiek.pl” nr umowy/decyzji POPC.02.03.01-00-0012/17; 

Okres realizacji projektu:
od 01.11.2017 do 31.10.2020 r.

Całkowita kwota projektu:
Finansowanie dla projektu Uniwersytetu Łódzkiego wynosi 6.669.971,00 PLN. Kwota dofinansowania ze środków europejskich to 5.644.796,45 zł

e_czlowiek